Lexique DocSciences n°8

Des espèces en nombre

Symbiose - Parasitisme : Association durable et souvent obligatoire entre individus d’espèces différentes pendant tout ou partie de leur cycle de vie. Il existe de très nombreuses formes de symbiose (anémone de mer / poisson clown ; vache / bactéries digestives ; puceron / bactérie intracellulaire). Dans une définition restreinte, la symbiose (ou mutualisme) décrit une relation à bénéfice réciproque entre partenaires associés. Dans une définition plus large, elle inclut le parasitisme (le parasite vit aux dépens de son hôte et peut même le tuer). Il n’existe pas de frontières nettes entre ces deux cas extrêmes, mais un continuum de relations symbiotiques dans lesquelles les partenaires peuvent s’entraider, se déchirer ou même s’ignorer réciproquement.

Cultivons notre jardin

Biomasse : Matière végétale issue de la photosynthèse.

Itinéraires culturaux : Pratiques agricoles sur les cultures du semis jusqu’à la récolte pour optimiser la production. Morphogénèse : Processus, résultat de la photosynthèse qui combine la production d’organes par les méristèmes et leur expansion pour aboutir à l’architecture de la plante.

Vers la cellule virtuelle

Biotechnologies : L’application des techniques biologiques à des fins pratiques concernant par exemple la santé, l’environnement, l’agriculture et l’agroalimentaire.

Enzyme : Protéine qui catalyse une réaction métabolique, c’est-à-dire qui accroît la vitesse à laquelle la réaction se produit.

Modèle mathématique : Représentation d’un système, biologique ou autre, par un ensemble de variables et de relations mathématiques entre ces variables, comme des équations différentielles. Un modèle simplifie, par définition, la réalité, mais préserve les aspects importants pour étudier un phénomène donné.

Réactions métaboliques couplées : Ensemble de réactions chimiques du métabolisme liées par un substrat ou un produit. Typiquement, une réaction métabolique est catalysée par une enzyme et transforme un substrat en un produit.

Simulation informatique : Prédiction par ordinateur de scénarios du comportement d’un système réel, à partir de son modèle et des conditions initiales choisies.

Décoder le vivant

Gènes : Segments d’ADN donnant naissance à une molécule d’ARN active qui elle-même pourra engendrer une protéine. Les gènes sont des caractères héréditaires élémentaires.

Macromolécules : Molécules géantes constituées à partir d’éléments de base qui peuvent s’associer à l’infini : caoutchouc, ADN, cellulose… L’ADN, l’ARN et les protéines sont les trois types de macromolécules fondamentales du vivant.

Protéines : Macromolécules constituées d’acides aminés assurant la plupart des fonctions de la cellule : elles servent d’éléments de structure (squelette), de motilité (myosine des muscles), de catalyseurs (enzymes), sont impliquées dans le transport, l’immunité, la signalisation…

La molécule sur écran

Activité catalytique : L’activité catalytique d’une enzyme consiste à accélérer jusqu’à des millions de fois et de façon hautement spécifique une réaction chimique du métabolisme cellulaire ou extracellulaire.

In silico : In silico signifie « dans l’ordinateur » par opposition à in vitro (en tube à essai) ou à in vivo (au sein d’un organisme).

Liaison covalente : Liaison chimique dans laquelle chacun des atomes liés met en commun un électron afin de former un doublet d’électrons liant les deux atomes.

Évolution et phylogénie

Chromosome : Le génome est composé de plusieurs fragments, les chromosomes. Chacun contient, au sein d’une structure protéique complexe, deux brins d’ADN, succession de quatre nucléotides distingués par leurs bases, appariés sous forme de double hélice.

Mutation : Une erreur dans la réplication de l’information génomique peut échapper aux processus de correction et être transmise à un descendant. On dit alors que ce descendant porte une mutation correspondant à la base entachée d’une erreur.

Phylogénie : Une espèce S1 peut subir à un moment donné de son histoire une spéciation ; elle donne naissance à deux nouvelles espèces S2 et S3. Décrire la phylogénie entre ces trois espèces consiste à dire que S1 est l’ancêtre commun à S2 et S3. Une représentation simple est un arbre avec une racine S1 et deux feuilles S2 et S3. On peut répéter ce raisonnement lorsque l’on a plusieurs espèces actuelles et construire ainsi un arbre dont elles sont les feuilles.